濒危榛子的遗传恢复力和适应

濒危物种的特点往往是在其种群历史中种群数量严重下降甚至濒临灭绝。此类威胁通常源于历史气候变化和人类活动。

对于小型、孤立的种群来说，遗传漂变可能导致近交衰退、遗传多样性的侵蚀和有害突变的积累，从而进一步降低其适应潜力，并在面临不稳定的自然栖息地或气候时增加灭绝风险。阐明受威胁物种的人口历史以及基因组侵蚀对濒危的影响对于实施有效的管理和保护至关重要。

榛子(CCH)，即中国榛子，在第三纪时期广泛分布于亚洲各地。然而，它现在已濒临灭绝，仅断断续续地分布在中国亚热带的中高山地区。值得注意的是，其遗传特征、人口历史和适应潜力在很大程度上仍然未知。

为此，来自中国的一组研究人员生成了第一个濒临灭绝的中华木的染色体水平基因组，进行了基因组学和保护基因组学研究，并将种群崩溃、局部适应和遗传恢复的基因组特征与其同域分布进行了比较C. kwechowensis–C.云南复合体(CKY)。

该研究发表在《植物多样性》杂志上。

“我们在所有榛属物种中发现了大规模的基因组重排，并在榛属中发现了物种特异性的扩展基因家族，这些基因家族可能与适应有关，”共同通讯作者王兆山说。 “群体基因组学显示，CCH 和 CKY 都分化为两个遗传谱系，形成了西南-北部分化的一致模式(SW vs. N)。”

具体而言，人口统计推断表明，自中新世晚期以来，狭窄的SW谱系(CCH_SW和CKY_SW)的种群规模持续下降，而广泛的N谱系在第四纪期间保持稳定(CCH_N)甚至从种群瓶颈中恢复(CKY_N)。

与 CKY 相比，CCH 显示出相当的基因组多样性和杂合性，但通过纯合性运行测得的近交水平更高。然而，CCH 携带的有害突变明显少于 CKY，因为更有效的清除选择减少了纯合变异的积累。

“我们还在不同谱系中检测到显着的正选择和适应性基因渗入信号，这促进了有利变异的积累和局部适应的形成。因此，选择和外源基因渗入两种类型都可以减轻近交并促进异交CCH的生存和持久性”，王补充道。

总的来说，这项研究为濒危树木的谱系分化、当地适应和未来恢复的潜力提供了重要的见解。

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